https://extendedlab.ru/?utm_source=utm_source%3Dbiomolecula.ru&utm_medium=utm_medium%3Dbanner&utm_campaign=utm_campaign%3Dbiomolecula&utm_content=utm_content%3Dperehod_ot_biomolekula&utm_term=utm_term%3Dbiomolecula
Подписаться
Биология

Биофизика

Биофизика

Если XX век стал веком развития междисциплинарных наук, таких как биофизика, то в XXI веке взаимодействие между различными областями знаний становится еще более тесным. В этой рубрике читатель найдет статьи, рассказывающие о том, что такое молекулярная биофизика, об истоках молекулярного моделирования, о молекулярных поверхностях и о том, как биологические модели становятся объектом вдохновения. В этой рубрике много работ, посвященных описанию современных методов физико-химического анализа биомолекул; сюда также относятся статьи о том, как изучают фолдинг белка: особенности его пространственной упаковки (даже в том случае, когда четкой упаковки вообще не существует); а также обзоры о биомембранах и мембранных белках. Особый интерес представляют репортажи из МФТИ по биофизике сердечной аритмии.

Сортировка

Формат статьи

Конкурсные статьи

Период публикации

  • Физтех-био
    Победитель «Био/мол/текст»-2016
    Места
    Лаборатория перспективных исследований мембранных белков: от гена к ангстрему
    Обзор
    GPCR Биомембраны Биофизика Места Рецепторы Структурная биология
    Лаборатория перспективных исследований мембранных белков: от гена к ангстрему
    3523 1,3
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Лаборатория перспективных исследований мембранных белков МФТИ существует с 2011 года. За прошедшие пять лет она сильно расширила направления исследований, приютила несколько редчайших установок, объединила совершенно неповторимых людей и обзавелась собственной учебной базой. Интерес лаборатории — в исследовании (как вы уже догадались) мембранных белков: их структуры, функций и взаимосвязи между структурой и функциями. О том, как построить полноценный «конвейер» по исследованию белка, и в какие страны ездят студенты лаборатории в период обучения — читайте в этом материале.
    0 Егор Марьин 04 сентября 2016
  • «Био/мол/текст»-2016
    Своя работа
    Охотники за кристаллами
    Обзор
    Биомолекулы Биофизика Структурная биология
    Охотники за кристаллами
    929 0,4
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: В повседневной жизни мы сталкиваемся с кристаллами ежедневно, создавая любимый вкус привычной пищи с помощью соли и сахара. Причем нас, как правило, не волнует, как возникают такие кристаллы и что с ними еще можно сделать. В Институте белка РАН кристаллизуют биомолекулы для изучения их пространственной структуры и понимания взаимодействий атомов, составляющих эти вещества. Умение закристаллизовать биомолекулу балансирует на грани науки и искусства, точного расчета и интуитивных ощущений. На этот процесс может влиять множество факторов: природа биомолекулы, ее гомогенность, выбранный метод кристаллизации, температура помещения, где проходит кристаллизация, вибрация и даже электромагнитное излучение. Иногда лишь определение структуры молекулы позволяет предположить ее функциональное значение и положить начало поиску ингибиторов или активаторов.
    0 Светлана Тищенко 29 июля 2016
  • Физтех-био
    Лаборатория компьютерного дизайна материалов: что может дать USPEX?
    Обзор
    Биотехнологии Биофизика Места Структурная биология
    Лаборатория компьютерного дизайна материалов: что может дать USPEX?
    2587 0,8
    Лаборатория компьютерного дизайна материалов МФТИ под руководством известного российского ученого Артема Ромаевича Оганова занимается предсказанием кристаллических структур. Ученые, обладая уникальным инструментом для теоретического анализа вещества, работают над колоссальным множеством проектов. Они ищут новые полезные материалы, исследуют содержимое земных недр и других планет, улучшают лекарства и решают задачи по предсказанию структуры белков. В лаборатории трудится большой интернациональный коллектив, часть направлений работы которого описана в этой статье.
    1 Мария Валиева 03 июля 2016
  • Физтех-био
    Лаборатория биофизики возбудимых систем: сердце, его вихри и фотоуправление
    Обзор
    Биофизика Медицина Места
    Лаборатория биофизики возбудимых систем: сердце, его вихри и фотоуправление
    2186 1,1
    Любимый подопытный орган в лаборатории биофизики возбудимых систем Московского Физтеха — сердце. Ученые исследуют причины возникновения аритмий и учатся контролировать свойства тканей с помощью света. В норме волны возбуждения, пробегая по сердцу, координируют его сокращения. Если возбудимая ткань нарушена, то такие волны могут разрываться. К чему это приведет? Оказывается, могут возникнуть вихри возбуждения, которые сбивают работу главного насоса организма. Как исследуют сердечное «волнение», управляют им, и вообще, почему всё это так важно — узнáем из первых рук.
    0 Мария Валиева 05 июня 2016
  • Свечение флуоресцентного белка осветило механизмы эпистаза Новость
    Биомолекулы Биофизика Флуоресценция Эволюционная биология
    Свечение флуоресцентного белка осветило механизмы эпистаза
    1373 0,7
    Большая интернациональная группа ученых, возглавляемая работающим в Барселоне биоинформатиком Федором Кондрашовым, совершила маленький прорыв в понимании эпистаза - процесса влияния друг на друга различных сайтов генома. Исследовав несколько десятков тысяч мутаций зеленого флуоресцентного белка (GFP), ребята создали экспериментальную модель эпистаза. Это позволит лучше изучить как сам эпистаз (крайне важный и любопытный момент фундаментальной эволюционной геномики), так и связанные с ним практические процессы.
    0 Вера Башмакова 12 мая 2016
  • Фемтосекундные рентгеновские лазеры — кристаллография будущего Обзор
    Биомолекулы Биофизика Вирусология Структурная биология
    Фемтосекундные рентгеновские лазеры — кристаллография будущего
    2273 1,1
    Метод рентгеноструктурного анализа до сих пор является «золотым стандартом» в исследовании пространственной организации биополимеров, в частности белков. Несмотря на это, он не лишен существенных недостатков и ограничений: необходимые кристаллы трудно получать, кристаллизуемые молекулы обычно помещают в условия, далекие от таковых в клетке (температура, ионная сила и т. п.), получаемая структура зачастую является «средним по палате», а информация о подвижности молекул и вовсе напрямую недоступна. Однако новые фемтосекундные рентгеновские лазеры сулят истинный переворот в области структурной биологии. Возможно, в скором будущем кристаллизовать и вовсе не придется, а исследователи будут снимать «кино» про единичные молекулы с атомарным разрешением.
    0 Антон Полянский 25 декабря 2015
  • «Био/мол/текст»-2015
    Лучший обзор
    Клетки под давлением
    Обзор
    Биофизика Рецепторы Цитология
    Клетки под давлением
    2099 1,0
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Вы не задумывались, что привычные нам животные, да и мы сами, могли бы выглядеть иначе? Жизнь началась с того, что образовалась клетка — единица всего живого, развитие которой происходило под действием внешних физических полей: гравитационного и электромагнитного. Изменение внешнего воздействия приводит к изменению механического напряжения внутри клетки, которое должно сопровождаться адекватной реакцией клетки без потери способности к самовоспроизведению и полноценной жизнедеятельности. Выраженность и последствия деформаций будут зависеть от собственных механических характеристик клетки и чувствительности ее механосенсоров, на роль которых претендуют различные структуры. Рассмотрим, что же известно о четырех из них: внеклеточном матриксе, механочувствительных ионных каналах, подмембранном и внутреннем цитоскелете.
    0 Мария Усик 08 декабря 2015
  • Победитель «Био/мол/текст»-2015
    Своя работа
    Как раскрыть секреты цитохрома <em>с</em>
    Обзор
    Биофизика Метаболизм Своя работа Цитология
    Как раскрыть секреты цитохрома с
    4284 2,1
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: «Только ленивый не занимался митохондриями!» — сказал один профессор. И действительно, митохондрии — очень популярный объект исследования, ведь в них происходит множество сложнейших биохимических и биофизических процессов, обусловливающих широкий набор функций данных органелл. Но, несмотря на активность исследователей, многие механизмы этих процессов и свойства отдельных компонентов митохондрий остаются загадкой. Это связано в первую очередь с отсутствием подходящих неинвазивных методик. В ходе междисциплинарного проекта, проводимого группой биофизики клетки Биологического ф-та МГУ и лабораторией неорганического материаловедения химического ф-та МГУ совместно с коллегами из Германии и Дании, удалось создать методику на основе спектроскопии гигантского комбинационного рассеяния для селективного исследования цитохрома с непосредственно в живых митохондриях. Статья опубликована в журнале Scientific reports.
    0 Эвелина Никельшпарг 06 декабря 2015
  • «Био/мол/текст»-2015
    Лучший обзор
    Спектроскопия КР: новые возможности старого метода
    Обзор
    Биотехнологии Биофизика Структурная биология Цитология
    Спектроскопия КР: новые возможности старого метода
    12020 4,7
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Спектроскопия комбинационного рассеяния света (КР) появилась более 80 лет назад и с тех пор широко используется в физике, химии и многих прикладных областях. Метод привлекателен тем, что на исследуемый образец воздействует только свет и ничего более, но при этом можно получать эксклюзивную информацию о свойствах объекта, которую нельзя получить другими методами. Однако минус КР для исследования живой клетки состоит в том, что получается сигнал со слишком низкой интенсивностью. Тем не менее за последние десятилетия появилось несколько усовершенствований, которые позволили значительно усиливать сигнал, что открыло широкие возможности для применения КР в исследованиях живых клеток и тканей. В обзоре будет рассказано о принципах данных подходов и об их применении для решения современных биофизических и биомедицинских задач.
    2 Эвелина Никельшпарг 05 декабря 2015
  • Лаборатория клеточного гемостаза (Центр детской гематологии имени Рогачева) Обзор
    «Сухая» биология Биофизика Места
    Лаборатория клеточного гемостаза (Центр детской гематологии имени Рогачева)
    1814 0,9
    Если сотрудник лаборатории клеточного гемостаза и тромбоза ФНКЦ ДГОИ в разговоре замечает: «Жизнь сложна», то это не обязательно значит, что ему тяжело живется (хотя ученому в России сейчас (да и всегда) действительно приходится непросто). Смысл внутрилабораторной шутки двойной: специальностью команды, ее путеводной звездой и идеологической базой является исследование динамики сложных биологических систем, закономерностей их устройства и регуляции, методов исследования и методов воздействия на них. Гематология, тромбоциты, гемостаз и тромбоз для нее составляют только главную область применения этого подхода. Правда, очень важную область.
    1 Михаил Пантелеев 25 октября 2015