Подписаться
Тимофей Довгуша

Тимофей Довгуша 0,0

СПб НИИ ЭиМ им. ПАСТЕРА

  • Белковые галлюцинации: как справляется <em>AlphaFold</em>? Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии Мнения
    Белковые галлюцинации: как справляется AlphaFold?
    1470 0,5
    Не успев пережить триумф нейросетей (в лице AlphaFold) в предсказании строения белков, структурная биоинформатика взялась за обратную задачу: подбор последовательности для заданной трехмерной укладки. Но решение этой проблемы пока сдерживается фундаментальными ограничениями, присущими и самой программе AlphaFold. В этой колонке я постараюсь объяснить, почему нейросети в структурной биоинформатике не стоит считать панацеей.
    0 Георгий Куракин 18 ноября 2022
  • «Био/мол/текст»-2022/2023
    Свободная тема
    ГМ-фаги на страже нашего здоровья
    Обзор
    Биология Биотехнологии Вирусология Медицина Микробиология
    ГМ-фаги на страже нашего здоровья
    638 0,3
    Статья на конкурс «Био/Мол/Текст»: Аббревиатура «ГМО» продолжает пугать многих людей по всему миру. Возможно, пугает даже больше, чем проблема антибиотикорезистентности бактерий. Что уж говорить о страхе перед вирусами, один из которых буквально несколько лет назад вызвал пандемию? Но что, если эти самые вирусы, да еще и генномодифицированные, смогут помочь нам в борьбе с бактериальными инфекциями? Что, если они окажутся нам не врагами, а друзьями? В этой статье мы разберемся, кто такие вирусы бактерий — бактериофаги, — чем они примечательны и как с их помощью мы, возможно, сможем предотвратить глобальную катастрофу.
    0 Никита Мефодовский 08 ноября 2022
  • Ультрасовременные методы
    Выделяем нуклеиновые кислоты: эволюция методов
    Обзор
    Биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК РНК
    Выделяем нуклеиновые кислоты: эволюция методов
    14395 5,3
    Пожалуй, самым распространенным «мокрым» методом в биологии является выделение нуклеиновых кислот. Именно от этого первого шага нередко зависит и результат многостадийного эксперимента — скажем, секвенирования важнейшего генома. Сколь разнообразны представители жизни на планете, столь же обширны и подходы к извлечению ДНК и РНК из клеток. Об этом — новая статья цикла «Ультрасовременные методы».
    1 Элина Стоянова 28 октября 2022
  • Юрий Нечипоренко и Михаил Супотницкий: «Вот зараза! Что такое вирусы, как с ними бороться и уживаться». Рецензия Рецензии
    Вирусология Детям
    Юрий Нечипоренко и Михаил Супотницкий: «Вот зараза! Что такое вирусы, как с ними бороться и уживаться». Рецензия
    206 0,1
    Не все книги о вирусах способны легко и понятно рассказать детям о том, как именно существуют самые загадочные жители нашей планеты, как наш организм реагирует на них и почему столь сложно им противостоять. Авторы щедро снабжают все описания наглядными примерами, но порой излишне эмоционально и в категоричной манере воздействуют на читателя. Тем не менее, подобное «пособие» будет полезно изучить ребятам, потому что, как подчеркивают сами авторы, — ознакомлен, значит вооружен.
    0 Элина Стоянова 19 октября 2022
  • Квантовая механика против ДНК Обзор
    Биофизика ДНК Структурная биология
    Квантовая механика против ДНК
    1165 0,5
    Современные работы о появлении в ДНК короткоживущих неканонических пар нуклеотидов оценивают их время жизни в 0,1–10 мс. Эти пары могут быть представлены в том числе редкими таутомерами. Недавня теоретическая статья Джима Аль-Халили и соавторов утверждает, что любые таутомеры в ДНК должны неправдоподобно быстро разваливаться, а протон водородной связи должен постоянно туннелировать между комплементарными нуклеотидами. Потребность опровергнуть английских ученых заставила меня написать продолжение нашей прошлогодней публикации. Чтобы было не скучно читать, я постарался написать о роли квантовой физики и роли физиков в понимании таутомерных свойств ДНК и РНК.
    0 Денис Семёнов 18 октября 2022
  • Разговоры
    Альберт Ризванов: о подходах к генной терапии орфанных заболеваний, регенеративной медицине и важности междисциплинарных исследований
    Обзор
    CAR-T Генная терапия Иммунология Медицина Онкология Персонализированная медицина
    Альберт Ризванов: о подходах к генной терапии орфанных заболеваний, регенеративной медицине и важности междисциплинарных исследований
    853 0,4
    Альберт Ризванов — профессор, Ph.D., доктор биологических наук, член-корреспондент Академии наук Республики Татарстан, директор научно-клинического центра прецизионной и регенеративной медицины института фундаментальной медицины и биологии, заведующий лабораторией OpenLab «Генные и клеточные технологии», руководитель отдела поисковых исследований НОЦ фармацевтики КФУ. Почетный профессор фундаментальной медицины Ноттингемского университета, Великобритания. Заслуженный деятель науки Республики Татарстан. Область научного интереса — регенеративная медицина, генная и клеточная терапия.
    0 Ольга Фадеева 07 октября 2022
  • Наука, описывающая жизнь — лауреаты Нобелевской премии по химии (2022) Новость
    Биология Биомолекулы Биотехнологии Нобелевские лауреаты
    Наука, описывающая жизнь — лауреаты Нобелевской премии по химии (2022)
    1339 0,6
    Химия была второй областью после физики, которую Альфред Нобель назвал в своем завещании. В 2022 году Нобелевская премия по химии присуждена Барри Шарплессу вместе с Мортеном Мельдалем за развитие клик-химии, а также Каролин Бертоцци за разработку методов биоортогональной химии.
    0 Диана Саликова 06 октября 2022
  • Крестный отец палеогеномики — лауреат Нобелевской премии по физиологии/медицине (2022) Новость
    Антропология ДНК Нобелевские лауреаты Эволюционная биология
    Крестный отец палеогеномики — лауреат Нобелевской премии по физиологии/медицине (2022)
    1243 0,5
    Сванте Паабо — шведский ученый и «крестный отец» палеогеномики — направления молекулярной антропологии, связанного с исследованием древней ДНК. Команда исследователей под его руководством расшифровала геном неандертальца и открыла новую группу гоминид — денисовцев, — а в октябре 2022 года Паабо получил Нобелевскую премию по физиологии или медицине «за открытия, касающиеся геномов вымерших гоминид и эволюции человека».
    0 Диана Саликова 04 октября 2022
  • Бренди Скиллаче: «Головы профессора Уайта». Рецензия Рецензии
    Медицина Тканевая инженерия
    Бренди Скиллаче: «Головы профессора Уайта». Рецензия
    188 0,1
    Бывают такие новости и достижения — с налетом нездоровой сенсации и даже скандала, больше подходящие для первых полос желтой прессы, чем солидных научных биомедицинских изданий. Пересадка головы человека как раз из разряда таких историй. Впервые о пересадке головы я услышала из новостей о Серджио Канаверо — в 2015 году он заявил, что готов пересадить голову российского программиста, страдающего наследственной и быстро прогрессирующей мышечной атрофией, на тело другого человека со смертью мозга. Успешная операция до сих пор не проведена, но СМИ с упоением обсуждали эту возможность, как будто бы больше подходящую для дешевого фантастического романа, чем для реалий серьезных биомедицинских исследований. До того, как открыла книгу Бренди Скиллаче, я не знала, что у Канаверо был именитый предшественник — нейрохирург Роберт Уайт, который задумался о пересадке головы еще в середине ХХ века, задолго до того, как трансплантология стала серьезной и уважаемой дисциплиной, а люди с пересаженными органами имели шанс прожить дольше нескольких месяцев. Книга Бренди Скиллачи повествует именно об этой невероятной истории.
    0 Елена Белова 03 октября 2022
  • Дэвид Куаммен: «Межвидовой барьер. Неизбежное будущее человеческих заболеваний и наше влияние на него». Рецензия Рецензии
    Биология Вирусология
    Дэвид Куаммен: «Межвидовой барьер. Неизбежное будущее человеческих заболеваний и наше влияние на него». Рецензия
    185 0,1
    Книга Куаммена — яркий образец научного репортажа. Вы не найдете здесь объяснений механизмов проникновения вируса в клетки человека или ответа иммунной системы. Автор живо и остро рассказывает о том, как именно распространялись инфекции, знакомит с главными героями и очевидцами. С неизменным юмором и должным уровнем оптимизма Куаммен проведет читателя по следам лихорадки Эболы, SARS, малярии и других заболеваний. Не забудьте солнцезащитный крем, перчатки — и не открывайте рот, когда смотрите наверх в джунглях, — межвидовой барьер от животных к человеку и обратно может быть преодолен играючи легко, все зависит от обстоятельств.
    0 Элина Стоянова 01 октября 2022