Подписаться
Антон Чугунов Биомолекула

Антон Чугунов 267,3

Институт биоорганической химии РАН

VK

В 2003 году я закончил кафедру биофизики биофака МГУ. Работаю старшим научным сотрудником в Лаборатории моделирования биомолекулярных систем Института биоорганической химии РАН. Я — сооснователь и главный редактор этого сайта. С 2007 года.

  • «Био/мол/текст»-2014
    Лучшая новость
    Мигранты микромира: почему плацента стала домом для бактерий?
    Новость
    Генетика Медицина Микробиология
    Мигранты микромира: почему плацента стала домом для бактерий?
    1194 0,6
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Широко распространено мнение, что плацента — полностью стерильный орган, от которого плод получает кислород и питательные вещества. Однако исследователи из Медицинского колледжа Бэйлора в Хьюстоне установили, что плаценту населяет сообщество условно-патогенных бактерий, микробиом которых аналогичен бактериальному микробиому полости рта. Кроме того, они обозначили причинно-следственную связь между вариациями в составе плацентарного микробиома и преждевременными родами.
    0 Диана Бирковская 01 ноября 2014
  • Хильда Эстбю, Ильва Эстбю: «Это мой конек: Наука запоминания и забывания». Рецензия Рецензии
    Биология Нейробиология
    Хильда Эстбю, Ильва Эстбю: «Это мой конек: Наука запоминания и забывания». Рецензия
    405 0,2
    Человеческий мозг — крайне загадочный орган. Он не желает открывать своих секретов, и одной из самых больших его тайн, без сомнения, остается память. В книге «Это мой конек» две сестры решили рассказать, что известно ученым об этой функции мозга и как живут люди, чья память отличается от наших представлений о нормальности.
    0 Анастасия Волчок 12 декабря 2020
  • Грэй Теодор: Молекулы. Рецензия Рецензии
    Биология Биомолекулы
    Грэй Теодор: Молекулы. Рецензия
    561 0,3
    Химия — одна из самых логичных, красивых, нужных в повседневной жизни наук. При этом химия — один из самых тоскливых, оторванных от жизни и ненавистных школьных предметов. Сложно найти корни этого рокового противоречия. Но возможно не стоит их искать, а вместо этого надо показать детям — и взрослым! — химию во всей ее красе и мощи и научить видеть химические закономерности в повседневных событиях, начиная от выпечки хлеба и заканчивая работой двигателя внутреннего сгорания.
    0 Вера Башмакова 25 ноября 2017
  • «Био/мол/текст»-2011
    Лучший обзор
    Молекулярное клонирование, или как засунуть в клетку чужеродный генетический материал
    Обзор
    Вирусология Генетика Генная инженерия ДНК Процессы
    Молекулярное клонирование, или как засунуть в клетку чужеродный генетический материал
    41097 19,0
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Огромное количество биологических исследований начинается с того, что в клетку вносится чужеродный генетический материал. Это действие называется молекулярным клонированием. С его помощью можно получить генетически модифицированные организмы, включить и выключить отдельные гены или определить роль конкретного белка в каком-нибудь процессе. Можно сказать, что молекулярное клонирование — это краеугольный камень, основа основ, фундамент, без которого множество замечательных методик было бы неосуществимо. Однако засунуть в клетку «неродную» ДНК не так-то просто: это длинный, трудоемкий и многоэтапный процесс. Молекулярному клонированию посвящены толстые книги, но, тем не менее, я попробую хотя бы немного рассказать о том, что это такое, и что нужно для того, чтобы все получилось.
    13 Вера Башмакова 30 октября 2011
  • Эпигенетические часы: сколько лет вашему метилому? Новость
    Генетика ДНК Диагностика Онкология Эпигенетика
    Эпигенетические часы: сколько лет вашему метилому?
    3785 1,8
    Геном постоянно накапливает изменения. И если пару десятков лет назад представления об этих изменениях навевали мысли об эволюционных масштабах времени, то сейчас мы всё больше узнаем о том, как наш генетический материал меняется прямо на глазах. Молекулярные часы — методика оценки времени эволюционного расхождения видов по анализу замен в ДНК, — уже стали привычной темой для научно-популярной литературы и журналистики, а вот оценка возраста отдельных клеток и тканей организма привлекла внимание совсем недавно. И выясняется, что поиск молекулярных маркеров, позволяющих сказать, сколько лет вам и вашим клеткам, не заглядывая в паспорт, может быть интересен с очень многих точек зрения: от диагностики болезней до поиска преступников и изучения самого процесса старения.
    0 Юрий Стефанов 19 июня 2014
  • Одна последовательность — одна структура: был ли Анфинсен неправ? Новость
    Биомолекулы Структурная биология
    Одна последовательность — одна структура: был ли Анфинсен неправ?
    1862 0,9
    С 1970-х годов в биохимии господствует представление, что аминокислотная последовательность белка уникальным образом определяет его трёхмерную структуру. Но вот теперь в новом исследовании обнаружено, что лимфотактин — небольшой белок семейства хемокинов — не только «балансирует» в физиологических условиях между двумя различными конформационными состояниями, но и выполняет две разные биохимические функции! Так был ли Анфинсен — один из основоположников теории фолдинга белка — неправ?
    6 Антон Чугунов 31 марта 2008
  • Белковые галлюцинации: как справляется <em>AlphaFold</em>? Обзор
    Биомолекулы Биотехнологии Мнения
    Белковые галлюцинации: как справляется AlphaFold?
    1452 0,5
    Не успев пережить триумф нейросетей (в лице AlphaFold) в предсказании строения белков, структурная биоинформатика взялась за обратную задачу: подбор последовательности для заданной трехмерной укладки. Но решение этой проблемы пока сдерживается фундаментальными ограничениями, присущими и самой программе AlphaFold. В этой колонке я постараюсь объяснить, почему нейросети в структурной биоинформатике не стоит считать панацеей.
    0 Георгий Куракин 18 ноября 2022
  • «Био/мол/текст»-2018
    Свободная тема
    Дарвин в сумасшедшем доме: эволюционный взгляд на психические расстройства
    Обзор
    Биология Депрессия Эволюционная биология
    Дарвин в сумасшедшем доме: эволюционный взгляд на психические расстройства
    3779 1,8
    Статья на конкурс «био/мол/текст»: Медицина — это часть биологии. «Ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции», — эти слова Феодосия Григорьевича Добржанского можно отнести и к медицине. Целое направление — эволюционная медицина — пытается отыскать эволюционные корни в нашем здоровье и болезнях, поражающих человеческие тела. В этом тексте эволюционные поиски будут проведены внутри психиатрии.
    0 Виктор Лебедев 28 августа 2018
  • Исторический геном стеллеровой коровы проливает свет на причины ее вымирания Новость
    Биология Своя работа Секвенирование ДНК
    Исторический геном стеллеровой коровы проливает свет на причины ее вымирания
    941 0,4
    Проанализировав ядерный геном стеллеровой коровы — морского млекопитающего, некогда обитавшего в северной Пацифике, — ученые пришли к выводу, что процесс вымирания этого вида начался задолго до прибытия человека современного типа в Берингию. Показано также, что последняя популяция этого животного, обнаруженная российскими моряками на побережье Командорских островов, была обречена на вымирание вследствие низкого генетического разнообразия.
    0 Артем Недолужко 14 апреля 2021
  • ИИ в биологии
    Как языковые модели покорили мир белков
    Обзор
    «Сухая» биология Биомолекулы Биотехнологии ДНК Синтетическая биология
    Как языковые модели покорили мир белков
    2280 0,6
    На фоне конкуренции между Microsoft, Google, Meta, Amazon и другими техногигантами за звание обладателя лучшего чат-бота, достижения аналогичных моделей в биохимии и структурной биологии остаются слегка за кадром. А успехи есть, и еще какие! В этой статье спецпроекта «Искусственный интеллект в биологии» «Биомолекула» постарается исправить несправедливость и расскажет, как работают «большие языковые модели» на последовательностях биомолекул и к чему их можно применить в биологии. Мы также обсудим аналогии между биополимерами и привычными нам текстами, которые позволяют применять языковые модели к белкам и ДНК. Не забудем поговорить и про нашумевший AlphaFold — причем будем его не только хвалить! Ну и как всегда, поделимся кейсами, которые уже меняют структурную и другие области биологии.
    1 Мария Кадукова 07 марта 2024