Молекулярка

• Бактерии придумали, как можно увеличить кодирующую способность своих геномов. В некоторых клетках бактериальной популяции происходят инверсии генов, что повышает гетерогенность популяции. Иногда инверсии захватывают и промотор, и тогда инвертированные промоторы могут запускать экспрессию новых участков генома! Таким образом, инверсия промоторов может выключать и включать экспрессию соседних генов. Авторы открытия разработали специальный инструмент, PhaVa, для обнаружения таких инверсий в бактериальных геномах. — Intragenic DNA inversions expand bacterial coding capacity.
• Присоединение остатков L-лактата к остаткам лизина в белках известно как лактилирование, и механизмы этого процесса долгое время оставались неизвестными. Китайские исследователи показали, что аланил-тРНК-синтетазы AARS1 и AARS2 (AARS1/2) являются внутриклеточными сенсорами L-лактата и присоединяют его к остаткам лизина в белках АТФ-зависимым образом. Кроме того, связывание AARS1 с L-лактатом приводит к тому, что AARS2 связывается с синтазой циклических GMP-AMP (cGAS), лактилирует и инактивирует ее. Таким образом, высокий уровень L-лактата в клетках через инактивацию cGAS подавляет врожденный иммунитет. — AARS1 and AARS2 sense l-lactate to regulate cGAS as global lysine lactyltransferases.

Рак

• Раковые клетки делятся быстро, и для этого им необходимо много железа, поэтому они повышают экспрессию поверхностного рецептора трансферрина TfR1. Чтобы заблокировать поступление железа в злокачественные клетки через TfR1, исследователи разработали гетеробиспецифическое антитело TransTACs, предназначенное для деградации поверхностных белков: оно способствует эндоцитозу TfR1 и белка-мишени, после чего они разрушаются в лизосомах. Мишенями TransTACs могут быть самые разные белки: рецептор эпидермального фактора роста EGFR, PD-L1, CD20 и химерные антигенные рецепторы (CAR). — Transferrin receptor targeting chimeras for membrane protein degradation, «Биомолекула»: «От медицинской онкологии к молекулярной биологии рака».
• Ученые из Университета Вашингтона также разработали новый метод интернализации мембранных белков. Они разработали специальные тэги, связывающиеся с белками-мишенями, — EndoTags, и представили тэги для двух мишеней — рецептора инсулиноподобного фактора роста-2 (IGF2R) и рецептора асиалогликопротеинов (ASGPR), а также рецепторов сортилина и трансферрина. — Designed endocytosis-inducing proteins degrade targets and amplify signals, «Биомолекула»: «Немного о железе. Теория».

Нейронауки

• Используя внутричерепные электроды, регистрирующие активность единичных нейронов, американские ученые показали, что у человека временнáя структура опыта обеспечивается изменениями активности нейронов гиппокампа и энторинальной коры. Благодаря временнóй структуризации опыта, которая включает в себя интеграцию представлений «что» и «когда», мы можем примерно представлять себе, что случится дальше. Структуризация опыта происходит очень быстро и снабжает нас способностью прогнозировать ближайшее будущее. — Human hippocampal and entorhinal neurons encode the temporal structure of experience, «Биомолекула»: «Ликбез по ЦНС».
• Китайские исследователи создали пространственный транскриптомный 3D-атлас коры мозжечка для двух приматов — макак и мармозеток — и мыши. Атлас построен на уровне отдельных клеток и визуализирует цитоархитектонику мозжечка на этом уровне. Кроме того, авторы работы описали различия между корой мозжечка приматов и мыши, что позволяет взглянуть на транскриптомику мозжечка с эволюционной стороны. — Cross-species single-cell spatial transcriptomic atlases of the cerebellar cortex.

Экология

• Американские исследователи представили распространение и поглощение сидерофоров, выступающих как биомаркеры низкого уровня железа, в меридиональной зоне восточной части Тихого океана. Сидерофоры в больших количествах присутствуют не только в водах, бедных железом, но и в «сумеречной» (верхней мезопелагической) зоне двух экосистем, играющих огромную роль в морском круговороте углерода, — субтропических круговоротах севера и юга Тихого океана. Авторы работы заключили, что доступность железа в сумеречных зонах в трех разных экосистемах Тихого океана лежит в основе дефицита железа в бактериальных клетках, и уровень железа может сдерживать рост океанической биомассы. — Microbial iron limitation in the ocean’s twilight zone, «Биомолекула»: «Пробиотики для растений: как накормить растущий мир».

Микробиология

• Ученые из Германии и США в ходе скрининга кишечных бактерий на способность разрушать иммуноглобулины A описали новый вид — Tomasiella immunophila. Эта бактерия стимулирует секрецию самораспознающих иммуноглобулинов с легкой цепью каппа, а везикулы, которые отпочковываются, содержат протеазы, которые и разрушают иммуноглобулины. Таким образом, T. immunophila стимулирует секрецию организмом-хозяином пищи для себя. — A host-adapted auxotrophic gut symbiont induces mucosal immunodeficiency.
• Американские и испанские ученые исследовали на предмет активности против малярийного плазмодия природные соединения изоцианотерпенового ряда, и обнаружили, что вещество под названием калихинол нарушает функционирование апикопласта и системы везикул. Однако конкретная мишень калихинола еще не идентифицирована. По всей видимости, калихинол действует на метаболизм липидов. —  A kalihinol analog disrupts apicoplast function and vesicular trafficking in P. falciparum malaria, «Биомолекула»: «Малярия. 15 фактов о болотной лихорадке».

Вирусология

• Респираторный синтициальный вирус (РСВ) особенно опасен для детей, пожилых людей и людей, страдающих от иммунодефицита. Главным иммуногеном вакцин против РСВ выступает F-белок, однако он имеет гибкую структуру, и для того, чтобы вакцина была эффективной, необходимо зафиксировать его в строго определенном положении. Китайские ученые изучили, какие участки F-белка отвечают за его гибкость, и мутация одной из аминокислот в этих сайтах позволила зафиксировать F-белок в нужном положении. — Mutating a flexible region of the RSV F protein can stabilize the prefusion conformation.